С 2008 года, в рамках лицензии ПГУ (Федеральная служба по надзору в сфере образования и науки Лицензия № 255933, регистрационный №8609 от 25 апреля 2007 г.) в медицинском институте ведется дополнительное профессиональное образование по более чем 30 программам. Это тематические усовершенствования, общие усовершенствования, первичные переподготовки. Основные направления образовательных программ соответствуют трем медицинским специальностям: лечебное дело, стоматология, фармация. По окончании образовательных программ участникам выдаются документы государственного образца. Основной контингент слушателей – медицинские работники со средним и высшим образованием.